El Consejo es el órgano político del ISM y tiene por objetivo definir, en coordinación con la Dirección Ejecutiva, las líneas estratégicas y programáticas, el presupuesto del ISM y los proyectos a ser ejecutados.
Está integrado por representantes gubernamentales de cada uno de los Estados Parte.
Representantes
Argentina – Ministerio de Desarrollo Social
Vanesa Wainstein, Mariana Perez Espinosa
Brasil – Ministerio de la Ciudadanía
Alfredo Ferreira, Pietra Couto
Paraguay – Ministerio de Desarrollo Social
José Soler, Fatima Mendez
Uruguay – Ministerio de Desarrollo Social
Yanella Posente, Victoria Pesce